La Federazione nasce a Torino nel 1995 da una gemmazione della  A.P.E.I. – Associazione Produttori Energia Idroelettrica, acquisendo la denominazione di Federpern. Dal 4 febbraio 2014 Federpern modifica la denominazione nell’attuale FEDERIDROELETTRICA, dandosi una connotazione molto più specialistica nel settore idroelettrico. Federidroelettrica opera a livello nazionale e conta attualmente numerose aziende che hanno prevalentemente in esercizio piccole e medie centrali idroelettriche (da 20 a 3.000 kw).
L’Assemblea nazionale del mese di settembre 2018 ha comportato una svolta operativa con la nomina del nuovo Consiglio Direttivo.
Il nuovo Statuto, approvato nel mese di maggio 2019, ha inoltre previsto l’istituzione del Consiglio Territoriale, che avrà il compito di gestire tutti i rapporti con gli Enti e le Istituzioni presenti sul Territorio, affinchè gli Associati possano avere un contatto diretto.